皖南医学院第二附属医院始建于1949年，前身系中国人民解放军皖南军区直属附院，1982年随着行政区划变更改称宣城地区人民医院，2012年11月经省政府批准整体划转皖南医学院作为直属附属医院，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复多功能于一体的公立三级甲等综合医院。医院本部（康复路院区）占地 78.2 亩，总建筑面积 13.66万平米，开放床位 1200张，设有 38 个临床科室、18 个医技及其他相关科室、31 个护理单元、1 个临床学院、1 个临床技能培训中心、1 个转化医学中心。现有职工 1300 余人，其中高级职称 185人，博、硕士 251 人。拥有安徽省江淮名医 2 人，安徽省医师杰出成就奖 1 人，安徽省卫生健康骨干人才 4 人，芜湖市华佗计划人才 24 人。
医院配备有先进的医疗设备，包括第四代达芬奇手术机器人、医用电子直线加速器（LA）、64排螺旋CT、3.0T及1.5T核磁共振、数字减影血管造影X线机（DSA）、全自动生化分析仪、全自动免疫分析仪、血管内超声系统、旋磨介入治疗仪、4K腹腔镜等大中型医疗设备。
医院坚持走特色办院之路，学科发展和特色专业建设取得了突出成绩。获批国家级标准心衰中心、国家级标准房颤中心、国家级基层胸痛中心、国家级防治卒中中心、国家药物/医疗器械临床试验机构。皮肤性病科获批安徽省临床重点专科、为皖南医学院第三批重点扶持学科、国家级皮肤医疗美容示范基地；心血管内科获批安徽省临床重点专科、安徽省“十三五”医疗卫生重点培育专科；普外科获批安徽省临床重点专科；泌尿外科获批安徽省“十三五”医疗卫生重点培育专科；普外科、皮肤性病科、康复医学科、急诊医学科、超声医学科获批芜湖市公立医院高质量发展学科高地示范项目；结直肠疾病科获批芜湖市公立医院高质量发展高峰学科；神经外科成功入选国家卫健委“神经外科建设中心”；呼吸与危重症医学科获评“国家PCCM科规范化建设三级医院达标单位”；康复医学中心获评“中国康复医学会呼吸康复规范化建设达标单位”。
医院多项医疗技术在省内处于先进水平，在腔镜、内镜、介入、急危重症救治和多学科诊疗方面不断实现新突破。如达芬奇机器人辅助腹腔镜应用技术、异基因造血干细胞移植术、肿瘤消融治疗技术、单孔腹腔镜前列腺癌根治术、经颈静脉肝内门腔静脉分流术、白癜风表皮移植术、帕金森病脑深部电刺激术（DBS）、经导管主动脉瓣置换术（TAVR）、经皮冠状动脉腔内旋磨术、胃肠超声造影技术等。
机构目前药物备案专业：泌尿外科专业、内分泌专业、呼吸内科专业、皮肤病专业、肿瘤科、I期临床试验研究室专业；
医疗器械备案专业：皮肤病专业、泌尿外科专业、康复医学科、医学检验科、心电功能科、肾内科、麻醉专业。
后续拟备案：消化内科专业、神经内科专业、心血管内科专业、血液内科专业、老年病专业、骨科专业、妇科专业、产科专业、儿科、急诊医学科、康复医学科等。